燕王朱棣攻入南京后，曾多次击败朱棣的盛庸深感无力回天，于是率余部投降。朱棣奉命盛庸驻守淮安，看住还死守在山东的昔日战友铁铉。接着朱棣派兵北上复攻济南，铁铉死守不肯投降，但终因寡不敌众，城池陷落。朱棣又设伏兵计擒铁铉，铁铉终于在淮南被俘，被押送到京师，盛怒的朱棣命令将他凌迟处决，年仅 36 岁。铁铉遇害后，其父母被发配到海南，他长子充军，次子做了官奴，后来被虐待而死。三十五岁的妻子杨氏和仅四岁的女儿也被籍没为奴，沦为乐户发配到当时的官营妓院，当时建文一朝的诸臣妻女们有很多都落到这个下场。

关于铁铉之死，史上一直流传着一个传说。铁铉见朱棣时，骂不绝口，立而不跪。朱棣使其面北一顾，终不可得。愤怒的朱棣令人割下铁铉的耳朵、鼻子，煮熟后塞入他口中，问他滋味如何。铁铉厉声说：忠臣孝子的肉有什么不好吃？盛怒中的朱棣让人架起油锅，把铁铉炸了。朱棣怒道：活着叫你朝拜我你不肯，炸成骨头灰你也得朝拜我！太监急忙把铁铉的骨架用铁棒夹着令其转身，没成想此时油锅里一声爆响，热油从锅里飞溅出来，直烫得太监们嗷嗷乱叫，铁铉的骨架硬是没有转身。

当然这些估计都是后人杜撰的，一方面是要表现朱棣的残暴，另一方面是要表现铁铉的忠义以及铮铮铁骨。在山东省济南市历下区天下第一泉风景区大明湖边有一个铁公祠，是清代乾隆五十七年（1792年）为了纪念铁铉而建的长方形祠堂。

铁铉被抓住凌迟后，朱棣给盛庸下了一道谕旨说：“以前山东未定，所以才命你镇守淮安。现在铁铉被俘，诸郡全部平定。朕念山东久为兵乱所困，疲于转输之劳。你应当抚兵养民，这样才符合我的心意。”盛庸接到朱棣的敕书，仔细琢磨了好久，明白了朱棣的意思，于是递上辞呈，告老还乡，朱棣龙颜大悦，马上予以批准。

可是不久，千户王钦给朱棣上奏，奏折中列举了盛庸自建文朝对朱棣所犯下的一堆罪行，并要求朱棣予以治罪，朱棣没有接受王钦的上奏，但是却进升王钦为指挥同知，都御使陈瑛见状也趁机弹劾盛庸心存怨恨，图谋不轨。盛庸听说王钦和陈瑛弹劾自己的内容后，想起老同事铁铉等人的遭遇后，意识到朱棣并没有完全放过自己，只有自我了断才是真正的出路，于是自杀而死。

我们再说说两位辅政大臣黄子澄与齐泰。黄子澄与齐泰是在南京沦陷前被召回南京，之前朱允炆为了平息众怒，把他俩贬到地方。南京危在旦夕之时，黄子澄和齐泰还未回到南京，南京已经沦陷，黄子澄已经知道建文帝失踪，就派人秘密寻找，自己也密谋和朱棣抗争，可由于内奸告密，黄子澄被捕。齐泰逃到了外郡图谋兴复建文帝的基业，后被燕军擒拿送到皇宫。齐泰的堂兄弟齐敬宗等人都被连坐诛杀，他的叔父齐时永、齐阳彦等发配边疆。只有齐泰仅六岁的儿子免死发配。朱棣亲自审问黄子澄，黄子澄抗辩不屈，磔（zhé）死，族诛。磔死，即是凌迟处死。族诛，据说是诛九族，也有人说是诛十族。当时家属被杀65人，异姓致死者54人，外亲400余人皆充军。黄子澄死后葬在昆山市的马鞍山，在昆山亭林园里可见到黄子澄的墓碑，上面镌刻着“明黄节悫（què）公子澄墓”8个大字，但他的坟墓已无从寻找。

南京城破之前，黄子澄的妻子许氏与儿子黄圭、黄玉、黄润、黄泽从老家来到苏州府，决心与黄子澄共赴国难。苏州知府姚善见局势难以挽回，有意要为忠臣义士留下血脉，就改变了他们的姓名、户籍与身份，以便能逃脱即将到来的大屠杀。黄圭改名为田立微，户籍改在苏州府昆山县，身份是位道士；二儿子黄玉改名为田彦修，身份是昆山县一农村的里正；三儿子黄润改名为田彦温；四儿子黄泽还是少年，也是改名换姓。4人均学会了昆山方言，忠臣之后终于逃脱了朱棣的大屠杀。

吏部侍郎练子宁，曾察觉到李景隆有通敌之嫌，遂奏请治以死罪，可是朱允炆不听。练子宁愤激叩首，大声呼道：“坏陛下事者，必此贼也！臣作为执法官吏，不能为朝廷除去卖国奸臣，死有余罪。既然陛下赦免李景隆，必不赦免臣之罪，请先将为臣杀死，以谢天下。”练子宁当朝痛哭不止，以死相谏，朱允炆马上宣布退朝，听不进忠臣之言。

建文三年（1401)，燕王大军逼近都城，大臣萧用道、周是修上书议论国事，指斥当权者误国，反而受到辱骂。练子宁正义词严地说：“国家已到了如此之地步，还不能容纳仗义执言的忠臣吗？”当权者这才羞愧的停止了互相攻击。建文四年（1402)，燕王朱棣攻破南京，遂将练子宁绑缚上朝。练子宁大义凛然，痛斥燕王篡权谋位，大逆不道。朱棣恼羞成怒，命人将练子宁的舌头割去。朱棣说：“我欲效周公辅成王。”练子宁闻言，用手伸进口里蘸着舌血，在殿砖上大书：“成王安在！”于是朱棣大怒，命磔尸（就是凌迟），并诛杀练氏族人151人，被放戍边的亲属371人，练子宁的家乡四百八十户人家惨遭横祸，无一幸免，仅幼孙练珍被侍婢救出，藏匿于民间，练氏才幸免被杀绝。

据《明史·王艮传》记载，王艮是明代哲学家，他是王阳明（守仁）的门生，他初名叫王银，王阳明替他改名为王艮。他后来创立传承阳明心学的泰州学派。朱棣称帝后，命人将呈给建文帝的千余封奏折分类，只留下关于兵农钱谷之事的，其余谩骂涉及朱棣的全部焚毁。朱棣此举显然是为了使得这些前朝大臣可以轻松上任，不要有任何的心理负担，著名的“大明管家”夏原吉便是建文帝旧臣得到明成祖朱棣重用的典范。朱棣进南京后，夏原吉被人逮捕献上。有人说夏原吉在建文帝时曾受重用，朱棣却将他释放，授予了户部左侍郎官职。后来夏原吉和蹇义等人详细制定了关于赋税、徭役等制度。夏原吉提出的三十多项建议，都简便而容易遵守。他说：“政策颁行后如果难以继续下去，将会加重人民的困苦。这是我不愿意看到的。”但是事情远没有朱棣想象的那么顺利，虽然他是朱元璋的亲儿子，但是依然被视为造反篡位之人，很多人宁愿死也不愿意投降朱棣。朱棣虽然可称得上一代明君，但他却并非性情仁厚之人。面对不服软、不合作的，朱棣毫不犹豫的亮出了杀戮之刀。

朱棣杀的第一类人是他最恨之人。首当其冲的便是力主建文帝削藩的黄子澄、齐泰，他们都被朱棣凌迟处死，株连九族，妻女一律入教坊司为妓女，其中因黄子澄受牵连的有345人。其次便是靖难之役中令朱棣吃尽苦头的兵部尚书铁铉，铁铉在济南死磕朱棣三个月，还差点把朱棣用铁闸砸死。朱棣当了皇帝后，将铁铉凌迟处死，父母发配到海南，长子充军，次子为奴，妻女也被发配到教坊司。

第二类人就是公然反抗他权威之人。因为公然反抗对朱棣皇权的影响更大，因此这些人的下场也更凄惨。其中著名的有吏部侍郎练子宁、监察御史高翔、明朝大儒方孝孺等人。我们上次说到练子宁在朝堂上对朱棣破口大骂，被割去舌头后依然不屈，朱棣大怒，将其凌迟处死，诛杀练氏族人百余位，流放亲属三百多人。高翔穿孝服上朝，朱棣命其脱去时宁死不从，先是被敲碎牙齿，又被缢死剥皮示众，亲戚朋友被流放戍边。朱棣还下令所有姓高的人赋税都增加，意图使世世代代的人都恨高翔。其中方孝孺受牵连而死者共873人，充军等罪者千余人。

此外，众多建文旧臣如卓敬、暴昭、毛泰、郭任、卢植、戴德彝、王艮、王叔英、谢升、丁志方、甘霖、董镛、陈继之、韩永、叶福、刘端、黄观、侯泰、茅大芳、陈迪等，史称：“忠愤激发，视刀锯鼎镬（huò）甘之若饴，百世而下，凛凛犹有生气。”他们的家属和亲人也被牵连，死者甚众，流放、被逼作妓女及被其它方式惩罚的人也不少。直至明仁宗朱高炽即位后，大部份人始获赦（shè）免，余下的人的后代却迟至明神宗朱翊钧时始获赦免，也就是过了160余年。在大肆诛杀之外，当月，朱棣将魏国公徐辉祖下狱，后释放并削其爵位。黄观是明代第一个连中三元者（另一人为商辂（lù）），他还是中国历史上两个“六首状元”之一（另一人为钱棨（qǐ）），所谓六首就是从秀才到状元，历经县试、府试、院试、乡试、会试、殿试均夺得第一，时人赞誉他“三元天下有，六首世间无”。此后历任翰林院修撰、户部右侍郎等职。靖难之役后，黄观及其妻女投江殉难，朱棣将其名从登科录上划去，剥去其状元名号。黄观死后，朱棣余怒未消，黄氏九族受诛，亲朋受监禁，谪戍者达百余人。知直到明万历二十四年（1596年），黄观始得昭雪，补谥“文贞”，在黄观的故居贵池上清溪建“黄公祠”。

历史上还有一个传说，说朱棣杀了三千宫女，这个传言出处是朝鲜的《李朝实录》，所以并不可信。在前些时候电视剧《大明风华》中，也展现出朱棣将前朝大批文武官员都被斩杀于宫中，这其中就包括了女主角孙若微的生父、御史大夫景清。那么问题来了，历史上是否真有景清这个人物？他的结局与电视剧中一样吗？首先要确定第一个问题，那就是景清在历史上确有其人。不过他的结局却比《大明风华》中要惨上太多。

《明史》上称其“倜傥尚大节，读书一过不忘”，意思就是说为人洒脱但注重大节，读书过目不忘。景清小时候家里很穷，但他却非常聪明，在家乡父老的资助下，景清得以入学读书。经过十多年勤学苦读，景清终于进入了大明王朝的最高学府国子监深造，相当于我们今天的学生考入了清华、北大。洪武二十七年（1394年），景清在殿试中发挥出色，最终以一甲第二名的身份荣获榜眼，并按惯例被授予翰林院编修之职，后又改任御史，成为大明王朝的一位言官。燕王朱棣经过三年多时间的征战，入主京师称帝，这便开启了《大明风华》中的第一幕场景。朱棣在登基称帝后，大肆捕杀忠于建文帝的大臣。真实历史上的景清并没有像电视剧中所演的那样被一刀砍死，而是向朱棣俯首称臣，并继续担任御史大夫之职。

一日早朝，景清身怀利刃入宫，打算在上朝之际刺杀朱棣。然而朱棣事先已得到了密报，于是在景清上朝时命人搜身，结果真的就发现了藏刀。朱棣当场质问景清说：“朕待你不薄，你为什么要加害朕？”景清怒斥道：“我要为故主报仇，手刃逆贼。”朱棣最忌讳听到“逆贼”二字，顿时让朱棣怒不可遏。他当即下令对景清施以剥皮酷刑，并肢解其身。同时还下令株连景清全族。结果不仅景清一人惨死，他的家乡父老也全部都遭到迫害，村子沦为了废墟。

朱棣称帝后的大屠杀